二次世界大战的冷战期间,古巴危机将美苏两大强国剑拔弩张,而发生在1968年5月的一起事件则无疑将危机推向一触即发的境地。刚刚结束漫长航行并原本准备退休的海军舰长迪米(艾德·哈里斯 Ed Harris 饰),被上司命令即刻做最后一次巡航,而他所需要驾驶的则是即将在退役后卖给中国的弹道导弹潜艇B-67。在航行期间,来自克格勃的布鲁尼(大卫·杜楚尼 David Duchovny 饰)也一同随行,并在潜艇上测试一种全新的设备。
瑞贝卡(伊娃·格林 Eva Green 饰)回到了童年生活过的临海小镇,在那里,住着一个她无论如何也要见到的人——儿时玩伴托马斯(马特·史密斯 Matt Smith 饰)。曾经的懵懂少年如今已经成长为男人,两人之间迅速的产生了奇妙的化学反应。没过多久,一场车祸夺走了托马斯的生命,悲痛欲绝的瑞贝卡做出了一个危险的决定——利用当代先进的基因克隆技术,复制托马斯的基因。十个月之后,一个名叫托马斯的婴儿呱呱坠地,作为生下他的母亲,瑞贝卡的心情十分复杂。